1. IntroducMicrobiología: definición, objetivo, partes e historia de la microbiología

Historia de la microbiología
Tipos de microorganismos: bacterias, virus, hongos y parásitos
Seguridad en el laboratorio biológico

2. Los microorganismos: definición y tipos: las bacterias, los virus, los hongos y los parásitos

3. La estructura bacteriana:
La cápsula y los elementos EPS
La pared bacteriana: grampositivos, gramnegativos y micoplasmas
La membrana celular
Los mesosomas
El espacio citoplasmático y los elementos internos: vacuolas, lisosomas, etc…
El flagelo bacteriano

4. El crecimiento microbiano:
Fases del crecimiento
Factores que influyen en el crecimiento
La ecuación de Monod
El crecimiento microbiano continuo: el quimiostato y el turbidostato
La medición del crecimiento microbiano

5. El cultivo y aislamiento de microorganismos
Los medios de cultivo: tipos
El cultivo puro, el cultivo mixto
Factores del crecimiento microbiano
Los medios selectivos de cultivo
Los medios diferenciales de cultivo
El enriquecimiento y el preenriquecimiento

6. El análisis microbiológico
Análisis cualitativo de microorganismos: ausencia/presencia de microorganismos en un muestra. El límite de detección
Análisis cuantitativo de microorganismos: técnicas para la cuantificación de microorganismos; métodos tradicionales/métodos moleculares/ métodos fluorométricos

7. Desinfección y esterilización
Consideraciones preliminares
Conceptos y definiciones
Diferencias entre desinfectar y esterilizar
Tipos de procesos: físicos y químicos
Resistencia de los microorganismos a los procesos microbiocidas

8. Taxonomía bacteriana
Microorganismos más relevantes y su repercusión:
Origen de los microorganismos y su filogenética
Problemática de cada uno de ellos
Formas de caracterizar a los microorganismos fenotípicamente o genotípicamente
Creación de nuevos taxonesratori
El laboratorio microbiológico

Fabricación de los medios de cultivo
Análisis microbiológico cuali y cuantitativo de un agua contaminada
Practica de aislamiento y enriquecimiento microbiano
Tinción de Gram
Tinción de esporas
Identificación de los microorganismos aislados
Práctica del crecimiento microbiano
Práctica de la esterilización de un producto y comprobación de la misma

La biotecnología microbianaprácticas)

1. Biotecnología y Microbiología Industrial: conceptos generales, alcance, desarrollo histórico y aplicaciones
2. Microorganismos con interés biotecnológico e industrial: diversidad, aislamiento, selección y mantenimiento.
3. Mejora y desarrollo de microorganismos industriales. Mutagénesis y selección de mutantes. Recombinación. Métodos de screening.
4. Mejora y desarrollo de cepas. Tecnología del ADN recombinante (Introducción a la Ingeniería Genética). Análisis Metagenómico
5. Bioprocessing. Aspectos generales de las fermentaciones. Medios de cultivo (generalidades). Diseño y optimización de medios de fermentación (métodos estadísticos). Esterilización. Preparación de inóculos.
6. Bioprocessing. Sistemas de fermentación. Diseño de biorreactores. Escalado
7. Bioprocessing. Recuperación de los productos de fermentación. Tratamiento de residuales. Aspectos económicos
8. Bioprocessing: Producción de metabolitos por células y enzimas inmovilizadas. Biotransformación microbiana
9. La biotecnología aplicada a los procesos sostenidos
10. Procesos de producción mediante química convencional
11. Concepto de procesos industriales ecológicamente sostenidos
12. Concepto de minimización de residuos y reaprovechamiento de los subproductos
13. La Green chemistry
14. La aplicación de la biotecnología a procesos sostenidos:
o Elaboración de productos mediante biotecnología en comparación con los procesos químicos convencionales
o Ejemplos de procesos alternativos biotecnológicos

Microbiología clínica (80 horas: 32 teóricas, 8 horas seminarios, 40 horas prácticas)

1. Introducción a la microbiología clínica
Concepto de patógeno
Concepto de infección y tipos
Procesos infectivos
Mecanismos de patogenicidad y virulencia
La biota normal humana
• La microbiota normal
• La microbiota patógena

2. Laboratorio de ensayo
Muestreos y procesamientos
Métodos de trabajo en el laboratorio
Seguridad en el laboratorio
Control y garantía de calidad:
• La normativa ISO 17025
• Concepto de garantía de calidad en el laboratorio
• Controles de rutina en el laboratorio
• Calibraciones/Cualificaciones/Verificaciones

3. Los riesgos biológicos
Grados de biopeligro
Patógenos según su nivel de peligrosidad
Normativa legal específica
Aplicación de la normativa a los laboratorios y centros sanitarios

4. El hospital
Infecciones nosocomiales
Procesos de desinfección y asepsia
Tratamiento de residuos sanitarios

5. El urinocultivo
Consideracionres clínicas
Muestreo y tipos
Transporte y conservación
Exámen bacteriológico y cultivo
Métodos de screening alternativos
Métodos adicionales para situaciones especiales
Métodos automatizados

6. El coprocultivo
Consideraciones clínicas
Muestreo y tipos
Transporte y conservación
Examen bacteriológico y cultivos
Bacterias productoras de toxinas y bacterias invasivas

7. El tracto respiratorio
Patógenos de las vías altas y vías bajas
Muestreo y tipos
Transporte y conservación
Exámen bacteriológico y cultivo
Métodos básicos y específicos para la bacteriología

8. La sangre (hemocultivo)
Indicaciones clínicas
Muestreo : número de muestras y volumen
Transporte y conservación
Exámen bacteriológico y cultivo
Procesamiento de los cultivos positivos y su significado
Automatización

9. ETS (tracto genital)
Consideraciones clínicas
Tipos de muestras y muestreo
Examen bacteriológico y cultivo

10. SNC
Vías de infección y agentes
LCR
Muestreo
Transporte y conservación
Examen bacteriológico y cultivo
Cultivos básicos y específicos
Métodos alternativos de diagnóstico

11. Piel y mucosas
Tipos de infecciones y agentes
Muestreos
Procesamientos
Agentes anaeróbicos
Agentes y tipos de infecciones
Muestreos, conservación y transporte

12. La virología clínica
Taxonomía de los virus patógenos
La patogenia de las infecciones víricas
Los casos más característicos y frecuentes de infecciones víricas
El diagnóstico clínico y de laboratorio de las infecciones víricas

13. La parasitología clínica
Taxonomía de los parásitos: tipos según sus características generales
La patogenia de las infestaciones
Los casos más característicos de infestaciones en nuestra sociedad
El diagnóstico de laboratorio, la observación al microscopio

Antimicrobianos (80 h: 40 h teoría y 40 h prácticas)

1. Antibióticos: Clasificación, Espectro y Mec

1.1 Clasificación: Antibióticos activos sobre la pared celular bacteriana: Mecanismo de acción de los Beta-lactámicos, glicopéptidos y fosfomicina; Antibióticos activos sobre la síntesis de proteínas o ácidos nucleicos: mecanismo de acción de los aminoglicósidos, quinolonas, grupo macrólidos, estreptograminas y lincosamidas (MLS), mecanismo de acción de otros antibióticos.

1.2 Antibióticos antituberculosos: Moléculas activas frente a micobacterias atípicas y mecanismos de acción, mecanismos de resistencia de las micobacterias, epidemiología.

2. Resistencia de las Bacterias a los Antibióticos

2.1 Mecanismos de Resistencias: Generalidades, Resistencia a los beta-lactámicos, aminoglicósidos, quinolonas, glicopéptidos, macrólidos y cetólidos, resistencia a otros antimicrobianos

3. Farmacodinama de los antibióticos

3.1 Aspectos fundamentales y prácticos: Concentración Mínima Inhibitoria (CMI), Farmacodinamia de los Aminoglicósidos, Beta-Lactámicos, Fluroquinolonas, Glicopéptidos: Cinética bactericida, efecto post-antibiótico (EPA), resistencia adaptativa

4. Clasificación clínica de los antibióticos

4.1 Concentraciones: Cepa Sensible, Intermedia o Resistente. Espectro de Actividad de un Antibiótico (Normas Europeas)

4.2 Principales fenotipos de resistencia de las bacterias aerobias gram negativas: a los principales antibióticos: Betalactámicos, Aminoglicósidos y Quinolonas (Enterobacterias y Pseudomonas aeruginosa), fenotipos de resistencia de Acinetobacter spp a los antibióticos, fenotipos de resistencia de Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, Neisseria gonorrhoeae y Moraxella catarrhalis a los antibióticos

4.3 Principales fenotipos de resistencia de las bacterias gram positivas: Estafilococos, resistencia a los Beta-Lactámicos, Aminoglicósidos, Tetraciclinas, grupo MLS, Cloramfenicol, Cotrimoxazol, Quinolonas, Fosfomicina, Ácido Fusídico, Rifampicina, Glicopéptidos, Oxazolidinonas, resistencias asociadas. Enterococos: resistencia a los Beta-Lactámicos, Aminoglicósidos, grupo MLS, Glicopéptidos y Oxazolidinonas. Neumococo: resistencia a los Beta-Lactámicos, grupo MLS, Cloramfenicol, Tetraciclinas, Glicopéptidos, Quinolonas, Oxazolidinonas, Rifampicina y Aminoglicósidos

5. El Antibiograma
5.1 Introducción, métodos para la realización de un antibiograma, Kirby-Bauer o Difusión en Disco, Macro y Microdilución, Épsilon Test (E test).

5.2 Realización sistemática del Antibiograma: Principales causas de errores, Control de Calidad. Detección de los principales mecanismos fenotípicos y genotípicos de resistencias actuales en gram positivos y gram negativos (BLEE, MRSA, GISA, Carbapenemasas, resistencias intrínsecas, sinergias de antimicrobianos)

6. Antifúngicos6.1 Mecanismos de acción y resistencia a los antifúngicos, Evolución histórica de los Antifúngicos, resistencia microbiológica y clínica a los antifúngicos, tipos de resistencia clínica y predicción de respuesta clínica, Factores que contribuyen a la resistencia antifúngica y al fracaso terapéutico, Patrones normales de sensibilidad en levaduras y hongos filamentosos, herramientas para la identificación de hongos a través del antifungigrama,

6.2 Antifúngicos sistémicos, mecanismo de acción, mecanismos de resistencia asociados, Polienos, concepto, estructura, anfotericina B, resistencia cruzada con los azoles, Azoles, mecanismo de acción, mecanismos de resistencia asociados en levaduras y hongos filamentosos, Equinocandinas, mecanismos de acción, mecanismos de resistencia
7. Antivirales

7.1 Generalidades, viricidas, antivirales, inmunomoduladores, antivirales que impiden la entrada del virus a la célula, antivirales que actúan sobre la fase de replicación del genoma viral, antiretrovirales, inhibidores de la transcriptasa inversa del VIH (nucleósidos, nucleótidos y no nucleósidos, inhibidores de la proteasa IP), inhibidores de la integrasa.